Perpustakaan Instiper memiliki fungsi sebagai pendukung terwujudnya misi lembaga induknya, yaitu Institut Pertanian Stiper. Dukungan ini dilakukan melalui penyediaan informasi yang mendukung aktifitas pengajaran, penelitian dan pengabdian pada masyarakat yang dilakukan di lingkungan Institut Pertanian Stiper Yogyakarta. Menyelenggarakan Layanan Jasa Pendidikan dan Pengembangan SDM serta IPTEK Industri Perkebunan dan Perhutanan yang merupakan misi Institut pertanian Stiper menjadi pusat dari seluruh layanan di Perpustakaan Institut Pertanian Stiper. Seiring dengan perkembangan informasi dan teknologi yang pesat, Perpustakaan Institut Pertanian Stiper memandang perlu untuk mempersiapkan diri menjadi pendukung yang efektif dan efisien demi terwujudnya misi tersebut.